วัดแฮอินซาเป็นหนึ่งในสามวัดที่ใหญ่ที่สุดของเกาหลีใต้ สร้างขึ้นครั้งแรกเมื่อปี 802 สมัยอาณาจักรชิลลาโดยภิกษุนาม "ซูเนียง" (Suneung) และ "อิชอง" (Ijeong) ซึ่งเดินทางกลับจากประเทศจีน กล่าวกันว่าภิกษุทั้งสองรักษาอาการป่วยแก่มเหสีของพระเจ้าแอจางจนหาย ด้วยความระลึกและศรัทธาพระเจ้าแอจางจึงโปรดให้สร้างวัดแห่งนี้ขึ้นในรัชศกที่ 3
ชื่อวัด "แฮอิน" มาจาก "Haeinsammae of Hwaeomgyeong" หมายถึง "โลกแห่งการตรัสรู้และจิตที่บริสุทธิ์" โดยใช้เป็นสถานที่เก็บพระไตรปิฎกไม้อายุกว่า 700 ปี ภายในวัดยังมีโบราณวัตถุหลายชิ้นที่ได้รับการขึ้นทะเบียนเป็นสมบัติชาติเก็บรักษาเอาไว้ สะท้อนให้เห็นถึงช่วงเวลารุ่งเรืองของพุทธศาสนาในอดีต